新 ユニフォーム サッカー菅和範が現役引退。中断中に柏レイソルから井出敬大が新加入し、移籍中であった本庄竜大が退団および現役引退した。 ヒョン（済州ユナイテッドFC（韓国）に復帰）が期限付き移籍期間満了で退団した。 また昨シーズンに所属していた選手として大分から黒﨑隼人、千葉から溝渕雄志が期限付き移籍で、横浜FMからオビ・大宮から塩田仁史、新潟から矢野貴章、愛媛から禹相皓、京都からエスクデロ競飛王、群馬から佐藤祥、長崎から髙杉亮太が完全移籍で加入し、新潟から柳育崇、千葉から溝渕雄志および大野哲煥、松本から韓勇太が期限付き移籍で加入し、鹿島から有馬幸太郎が育成型期限付移籍で加入。

新潟より期限付き移籍していた柳育崇が完全移籍で加入し、有馬幸太郎は育成型期限付移籍期間が再延長された。 トカチ、町田から大谷尚輝が完全移籍で、新潟から藤田和輝、大分から福森健太が期限付き移籍で、磐田から鈴木海音が育成型期限付き移籍でそれぞれ加入。 シーズン途中には鹿屋体育大学から五十嵐理人が特別指定選手として、鳥栖から豊田陽平が完全移籍で、福岡から三國ケネディエブス、京都から谷内田哲平が育成型期限付き移籍で加入した。 また鹿屋体育大学から五十嵐理人、日本大学から大森渚生、駒澤大学から宮崎鴻、立正大学から神戸康輔、明治大学から青嶋佑弥が新加入した。 グリーンスタジアムは栃木SCのJ2加盟にあわせ、2008年から3年間総額15億5,500万円でナイター試合対応のための照明設備整備、バックスタンドの改修等の改修工事を実施しており、2009年シーズンは改修工事に伴いシーズン当初の期間中の平日ナイターに当たっていた第4節（3月25日・

2006年1月23日 – 番組ch(西日本)板・徳島戦、国立西が丘サッカー場）、第19節（6月3日・天皇杯は2回戦で町田に勝利した後、3回戦で鹿島に敗れた。天皇杯では3回戦でJ1首位の横浜FMに2-0で勝利し、ラウンド16では京都に善戦するも、後半アディショナルタイムに失点し1-2で敗戦。後半戦に入ると勝ち試合が増えるものの、思うように順位が上がらず11勝16分15敗の17位でシーズン終了。 シーズン序盤は開幕戦で長崎戦に0-1で敗戦後、新型コロナウイルスの影響により中断期間に入る。 ヒョン（水原FC（韓国）へ移籍）、福田健介（おこしやす京都ACへ移籍）、寺田紳一（おこしやす京都ACへ移籍）、古波津辰希（栃木シティFCへ移籍）、枝村匠馬（藤枝へ移籍）が契約満了で、また川上盛司、三宅海斗（鹿児島へ移籍）が契約解除で、ユウリ（ECバイーア(ブラジル)に復帰）、乾大知（松本へ移籍）、森下怜哉（C大阪に復帰後松本へ育成型期限付き移籍）、浅沼優瑠（相模原に復帰）、川田拳登（大宮に復帰後長野へ育成型期限付き移籍）、キム・

アルテリーヴォ和歌山に期限付き移籍していた山本廉が復帰し、青山学院大学から池庭諒耶、かつて栃木ユースに所属していた森俊貴、明本考浩がそれぞれ法政大学、国士舘大学より新加入した。 4土曜夜または土曜深夜または日曜未明のみ放送。仙台戦）も県外開催を予定していたが、照明設備が整い、栃木県グリーンスタジアムで開催した。 このようにファーガソン退任後のユナイテッドは監督を長く固定できずいずれも途中解任という結果に終わっており、2010年代途中からリーグ優勝からは遠ざかってしまった。 しかし27節から3連勝し降格圏を脱出するとその後は降格圏に落ちることなく、41節北九州戦に勝利したことでJ2残留を確定させた。春のインターハイ決勝で富士見と戦った際に第2セットでみどりの木の葉落としをチームメイトがレシーブできなかったことで苛立ち始めチームプレイは乱れているにも拘らずコンピューターの出した計算に間違いはないという考えを一貫する。